WEKO3
アイテム
Biliary microbiome profiling via 16 S rRNA amplicon sequencing in patients with cholangiocarcinoma, pancreatic carcinoma and choledocholithiasis
http://hdl.handle.net/10076/0002001640
http://hdl.handle.net/10076/000200164079d5582a-62dd-4408-a772-5eed29bafbd6
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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2025DM0916.pdf (2.03 MB)
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| アイテムタイプ | 学位論文 / Thesis or Dissertation(1) | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2025-11-04 | |||||||||||
| タイトル | ||||||||||||
| タイトル | Biliary microbiome profiling via 16 S rRNA amplicon sequencing in patients with cholangiocarcinoma, pancreatic carcinoma and choledocholithiasis | |||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||
| 言語 | ||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | Biliary Microbiome | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | Cholangiocarcinoma | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | Pancreatic carcinoma | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | Choledocholithiasis | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | 16S rRNA gene amplicon sequencing | |||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_db06 | |||||||||||
| 資源タイプ | doctoral thesis | |||||||||||
| アクセス権 | ||||||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||||||||
| 著者 |
水谷, 広樹
× 水谷, 広樹
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| 抄録 | ||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||
| 内容記述 | Recent studies have revealed that oral, gut, and intratumoral microbial dysbiosis significantly affects tumor progression, therapy resistance, and prognosis in cholangiocarcinoma (CCA) and pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) patients. However, the biliary microbiome, which directly interacts with malignant tissues, remains poorly understood. In this study, we analyzed the bile microbiota from 17 CCA, 15 PDAC, and 40 choledocholithiasis (CDL) patients using bacterial 16 S rRNA and fungal ITS sequencing. Principal coordinate analysis revealed significant differences in microbial communities between the cancer and CDL groups. The microbial community structure in each group demonstrated a specific pattern. Linear discriminant analysis revealed Streptococcus, Sphingomonas, and Bacillus enrichment in CCA patients, Neisseria, Sphingomonas, and Caulobacter in PDAC patients were more prevalent compared with CDL patients. Caulobacter was more prevalent, wheares Campylobacter was less in PDAC patients than in CCA patients. Fungal DNA was detected in ~ 50% of the samples, with CCA and PDAC patients. KEGG pathway analysis revealed altered metabolic pathways, including peptidoglycan, sphingolipid, and fatty acid metabolism and bile acid metabolism, in CCA and PDAC patients. These findings highlight the potential role of the biliary microbiome in CCA and PDAC pathogenesis, offering new insights into disease mechanisms and biomarkers. | |||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||
| 内容記述 | ||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||
| 内容記述 | 本文 / Department of Gastroenterology, Mie Prefectural General Medical Center | |||||||||||
| 内容記述 | ||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||
| 内容記述 | 12p | |||||||||||
| 書誌情報 |
発行日 2025-09-25 |
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| DOI | ||||||||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||||||
| 関連識別子 | 10.1038/s41598-025-00976-6 | |||||||||||
| フォーマット | ||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||
| 内容記述 | application/pdf | |||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||
| 出版者 | 三重大学 | |||||||||||
| 出版者（ヨミ） | ||||||||||||
| 値 | ミエダイガク | |||||||||||
| 学位名 | ||||||||||||
| 学位名 | 博士(医学) | |||||||||||
| 学位授与機関 | ||||||||||||
| 学位授与機関識別子Scheme | kakenhi | |||||||||||
| 学位授与機関識別子 | 14101 | |||||||||||
| 学位授与機関名 | 三重大学 | |||||||||||
| 学位授与年月日 | ||||||||||||
| 学位授与年月日 | 2025-09-25 | |||||||||||
| 学位授与番号 | ||||||||||||
| 学位授与番号 | 甲医学第2340号 | |||||||||||
| 資源タイプ（三重大） | ||||||||||||
| 値 | Doctoral Dissertation / 博士論文 | |||||||||||
