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  1. 50 大学院生物資源学研究科・生物資源学部
  2. 50D 学位論文
  3. 博士論文 本文
  4. 2023年度

Systematic studies of plant pathogenic Coelomycetes

http://hdl.handle.net/10076/0002000793
http://hdl.handle.net/10076/0002000793
edbc30e0-1c01-4264-a7f5-fd4feae437d4
名前 / ファイル ライセンス アクション
2023DB0304.pdf 2023DB0304.pdf (31.3 MB)
Item type 学位論文 / Thesis or Dissertation(1)
公開日 2024-05-22
タイトル
タイトル Systematic studies of plant pathogenic Coelomycetes
言語 en
言語
言語 eng
資源タイプ
資源タイプ識別子 http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
資源タイプ doctoral thesis
アクセス権
アクセス権 open access
アクセス権URI http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
著者 UJAT, ANYSIA HEDY BINTI

× UJAT, ANYSIA HEDY BINTI

en UJAT, ANYSIA HEDY BINTI
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著者（ヨミ）
姓名 ウジャット, アニシア ヘディ ビンティ
言語 ja-Kana
抄録
内容記述タイプ Abstract
内容記述 Coelomycetes encompass asexual fungi with conidia formation within a cavity lined by fungal or fungal and host tissue. This grouping reflects the pre-molecular reliance on morphological characteristics for fungal classification. Phylogenetic relationships have transformed fungal identification, leading to a shift in traditional fungal taxonomy towards a more objective and reliable fungal systematics. This prompted the change in Fungal Nomenclature from a dual naming system to "One fungus, one name". Following the current taxonomic criteria, this study re-examines plant pathogenic genera under Coelomycetes, aiming to elucidate diversity and update the Japanese mycoflora through multi-locus phylogenetic analysis, morphological, and culture characteristics.
The first part of the study focuses on the genus Elsinoe (Elsinoaceae, Myriangiales), known for causing scab, spotted anthracnose, and morphological distortions on various plants, including crops and ornamental plants. The asexual morph of Elsinoe is characterized by an acervular coelomycetous fungus with polyphialidic conidiogenous cells, known as Sphaceloma. Twenty-three Japanese collections of Sphaceloma and Elsinoe were re-examined, resulting in the proposal of three novel species: E. hydrangeae, E. tanashiensis, and E. sumire, as well as the establishment of a new combination for E. akebiae. Additionally, taxonomic treatment based on herbarium species proposed new combinations for E. catalpae, E. japonicum, E. paderiae, E. peucedani, and E. zelkovae.
The second part of the study examines the genus Sphaerulina (Mycosphaerellaceae, Mycosphaerellales), which causes leaf spot on arboreous plants and occasionally on herbaceous plants, presenting similar symptoms as Septoria. Historically, some Sphaerulina fungi were classified as Septoria based on generic morphological criteria. However, multi-locus phylogeny has delineated Sphaerulina from Septoria into independent genera. A total of twenty-seven Japanese isolates previously identified as Septoria were re-examined, leading to the proposal of seven novel species (Sph. farfugii, Sph. hydrangeicola, Sph. idesiae, Sph. lapsanastri, Sph. miurae, Sph. styracis, and Sph. viburnicola), and the transfer of two species (Sph. duchesnea & Sph. nambuana) from the genus Septoria.
The third part discusses the genus Septoria (Mycosphaerellaceae, Mycosphaerellales), a widely distributed fungal pathogen linked to leaf spot disease. Despite exhibiting a Mycosphaerella-like sexual stage, the name Mycosphaerella does not apply to this genus. Septoria was traditionally distinguished by the host plant it infects. However, molecular data indicate that multiple species can infect the same host, and some Septoria species have a broad host range. A total of twenty-three isolates were examined, and the results show that Septoria species isolated from hemp are different from Septoria cannabis found on the same host plant in America, leading to the proposal of a novel species, Septoria cannabicola.
The last part investigates the genus Diaporthe (Diaporthaceae, Diaporthales) from asymptomatic Sakura trees in Japan. Traditionally, traits such as host specificity, disease symptoms, ascomata, and spore shape are used for the identification of new species. However, multi-locus analysis revealed homoplasy in Diaporthe. In this part of the study, a total of 31 isolates were examined from Prunus s.l. in Japan. Apart from multi-locus analysis, this chapter also uses the coalescent method to assist in species delimitation. This resulted in the identification of two novel species, D. endoprunicola and D. pseudoamygdali, along with three known species of Diaporthe and another three species within Diaporthe s.l.
This study demonstrates that an integrated approach comprising phylogenetic analysis, morphology, habitat, and host information has enhanced the understanding of fungal delimitation at the taxonomic level. While molecular analysis is crucial for delineating fungal species, morphological observations continue to be essential for species identification.
言語 en
抄録
内容記述タイプ Abstract
内容記述 分生子果不完全菌類は、真菌、または真菌と宿主組織で覆われた空洞内に分生子を形成する無性真菌類からなる。このグループ分けは、菌類の大規模分子系統関係が明らかになる以前の形態学的特徴よる分類体系を反映している。菌類の分子系統関係は、真菌の分類を一変させ、これまでの菌類分類学をより客観的で信頼性の高い真菌系統学へと移行させた。これを機に、菌類命名法も有生世代と無性世代にべつべつに種名を認める二重命名法から、1種の真菌に1つの名前を適用する方法、すなわち“One fungus, one name”に変更された。本研究では、現在の分類基準に従い、分生子果不完全菌類のうち植物病原性を持つ属を再調査した。多遺伝子座系統解析、形態学的特徴、培養特性を統合的に用い、多様性の解明と日本の菌類相に関する情報を更新することを目的とする。
第1章では、作物や観葉植物などの様々な植物にそうか病や葉の奇形などを引き起こすElsinoe 属（Elsinoaceae,Myriangiales）について概観する。Elsinoe属菌の無性時代は、Sphaceloma として知られるポリフィアライド型の分生子形成細胞を持つ、分生子層状の分生子形成様式を持つ分生子果不完全菌類である。23株の日本のSphaceloma とElsinoe 属菌が再調査され、その結果、E. hydrangeae、 E. tanashiensis、E. sumire の3 新種と、E. akebiae の新組み合わせが提案された。さらに、標本に基づく分類学的処理により、E. catalpa 、E. japonicum 、E. paderiae、E. peucedani、およびE. zelkovae の新組み合わせが提案された。
第2章では、木本植物やときに草本植物の葉に斑点症状を引き起こすSphaerulina 属（Mycosphaerellaceae, Mycosphaerellales）について調査した。かつて一部のSphaerulina 属の種は形態学的基準により、Septoria 属とし分類されていた。しかし、近年になって多遺伝子座分子系統解析により、Sphaerulina 属はSeptoria 属から独立した属に分類された。そこでSeptoria 属として記録されている計27株の日本分離株を再調査し、7新種（ Sph. Farfugii 、Sph. hydrangeicola、Sph. idesiae、Sph. lapsanastri、Sph. miurae、Sph. styracis、およびSph. viburnicola）を提案し、2種（Sph. duchesnea およびSph. manbuana）の新組み合わせを提案した。
第3章では、Septoria 属（Mycosphaerellaceae, Mycosphaerellales）について述べる。Septoria 属は、葉の斑点病に関連して広く分布している病原菌類で、有性時代はmycosphaerella-like である。Septoria 属は従来、感染した宿主植物によって区別されていた。しかし、分子系統解析で構築された系統樹のデータによると、複数の種が同じ宿主に感染する可能性があり、実際Septoria 属菌の中には広い宿主範囲を持つものもある。結果、アサから分離されたSeptoria 属菌はアメリカ産の同じ宿主植物から分離されたSeptoria cannabis とは異なることが示され、新種Septoria cannabicola が提案された。
また、日本の無病徴のサクラの樹から分離したDiaporthe 属を調査した。従来、新種の同定には、宿主特異性、病徴、子嚢果、胞子形状などの形質が用いられてきたが、多遺伝子座分子系統解析により、Diaporthe 属の類別が困難な同質性が明らかとなった。この研究では、日本広義サクラ類から分離された計31株を調査した。多遺伝子座分子系統解析とは別に、この章では種の区分を補強するため、合意系統樹を用いた種仮定を用いた。その結果、2 つの新種D. endoprunicolo とD. pseudoamygdali が同定され、既知の3 種のDiaporthe 属と3種の広義Diaporthe属菌が同定された。
分生子果不完全菌類は、子嚢菌門の無性時代の分類群の一つである。この研究は、系統解析、形態学的特徴、分布、宿主といった異なる形質からなる総合的な基準により、分類学的の種境界への理解が向上した
言語 ja
内容記述
内容記述タイプ Other
内容記述 本文/Graduate School of Bioresources, Mie University, Japan
内容記述
内容記述タイプ Other
内容記述 181p
書誌情報
発行日 2024-03-25
フォーマット
内容記述タイプ Other
内容記述 application/pdf
著者版フラグ
出版タイプ VoR
出版タイプResource http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
その他の言語のタイトル
その他のタイトル 植物病原性分生子果不完全菌類の分類学的研究
言語 ja
出版者
出版者 三重大学
出版者（ヨミ）
ミエダイガク
学位名
学位名 博士(学術)
学位授与機関
学位授与機関識別子Scheme kakenhi
学位授与機関識別子 14101
学位授与機関名 三重大学
学位授与年月日
学位授与年月日 2024-03-25
学位授与番号
学位授与番号 甲学術第2261号
資源タイプ（三重大）
Doctoral Dissertation / 博士論文
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Ver.1 2024-05-22 01:41:39.002168
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