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The phylogeny of Russula section Compactae inferred from the nucleotide sequences of the rDNA large subunit and ITS regions
http://hdl.handle.net/10076/13865
http://hdl.handle.net/10076/138655afdf468-1a83-49a8-a6f4-eb08f6ba9a67
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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50C16970.pdf (1.6 MB)
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| Item type | 紀要論文 / Departmental Bulletin Paper(1) | |||||||||||||||||
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| 公開日 | 2014-04-28 | |||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||
| タイトル | The phylogeny of Russula section Compactae inferred from the nucleotide sequences of the rDNA large subunit and ITS regions | |||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||
| 主題 | ITS region | |||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||
| 主題 | nuclear LSU rDNA | |||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||
| 主題 | Russula densifolia | |||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||
| 主題 | Russula nigricans | |||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||
| 主題 | Russula subnigricans | |||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||
| 資源タイプ | departmental bulletin paper | |||||||||||||||||
| 著者 |
下野, 義人
× 下野, 義人
× 広井, 勝
× 高松, 進
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| 抄録 | ||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||
| 内容記述 | Phylogenetic relationships with in Russula section Compactae were investigated using sequence data from the nuclear-encoded large subunit ribosomal DNA（n-LSU rDNA）and ITS region, including the 5.8 S rDNA. Forty-two sequences of the n-LSU rDNA and forty-nine sequences of the ITS region with outgroups were used in this study. Analysis of the n-LSU rDNA indicated that the Compactae section was divided into three large groups: group A comprised R.densifolia and R.adusta, group B comprised R. subnigricans, and group Ccomprised R. nigricans. The ITS region did not support the monophyly of group B. Subgroup B-5 was sister to all other taxa of the Compactae section in the NJ and MP trees, and subgroup B-1 grouped with group C. Consequently, R. densifolia and R. adusta（group A）and R. nigricans（group C）were considered largely monophyletic, but R. subnigricans（group B）was not monophyletic. Russula densifolia (group A）, but not R. adusta, were divided into six different subgroups. リボソームDNA28S領域（LSUrDNA）および5.8Sを含むITS領域の塩基配列に基づいて、ベニ タケ属クロハツ節の分子系統解析を行った。外群を含めて28S領域の解析には42個、ITS領域では49 個のシークエンスを用いた。最節約法（MP）に基づく、リボゾームDNAの28S領域の解析では、ク ロハツ節は大きな3群（groupA-C）に別れた。GroupAはクロハツモドキ（Russuladensifolia）とコゲ イロハツ（R.adusta）、GroupBはニセクロハツ（R.subnigricans）、GroupCはクロハツ（R.nigricans） で構成された。ITS領域の解析ではGroupBの単系統を支持しなかった。MPおよび近隣結合法（NJ） ではGroupB-5は今回の研究で用いたすべてのクロハツ節の個体と姉妹群を形成し、GroupB-1は GroupCと同群に属した。これらのことから、クロハツモドキとコゲイロハツを含むGroupAとクロ ハツを含むgroupCはともに単系統であると推測されたが、ニセクロハツ（groupB）は単系統ではな いと考えられた。コゲイロハツを除くとクロハツモドキの特徴を示す仲間は6小群に別れた。 |
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| 書誌情報 |
三重大学大学院生物資源学研究科紀要 巻 40, p. 65-75, 発行日 2014-03-01 |
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| 書誌レコードID | ||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||||||
| 収録物識別子 | AA12234310 | |||||||||||||||||
| フォーマット | ||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||||||||
| 内容記述 | application/pdf | |||||||||||||||||
| 著者版フラグ | ||||||||||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||||
| その他のタイトル | ||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||
| 値 | リボソームDNAの大サブユニット領域およびITS領域の塩基配列にもとづくベニタケ科クロハツ節の分子系統 | |||||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||||||
| 出版者 | 三重大学大学院生物資源学研究科 | |||||||||||||||||
| 資源タイプ（三重大） | ||||||||||||||||||
| 値 | Departmental Bulletin Paper / 紀要論文 | |||||||||||||||||
